基本程序
證券營業部設有資金專櫃辦理投資者的保證金存取業務。一般來講，證券營業部可接受的保證金存取方式包括:現金、轉賬支票、銀行匯票、主動劃轉等。有些營業部還可以接受銀行通存兌儲蓄存摺的資金劃轉，以及“一卡通”資金劃轉。
個人投資在存(或取)現金時，應持有股票賬戶卡、身份證及資金賬戶卡，由本人臨櫃辦理。在填寫完存(或取)款單並簽字後，將存(或取)款單與“兩卡一證”遞交給工作人員辦理；如不能親自臨櫃辦理取款手續，可委託代理人辦理，但代理人必須持有經過國家公證機關公證的代理授權書，並攜帶代理人身份證、股票賬戶卡，資金賬戶卡等證方可辦理。
法人投資者在證券營業部存取保證金，應由合法授權的資金調撥人員辦理。合法授權人辦理資金存取時，應持有股票賬戶卡、合法委託授權書、本人身份證等證件。一般來說，在法人賬戶中提取資金，要經過證券營業部的部門負責人對委託授權書的真實性、合法性進行審查並在取款單上簽字確認後方可進行。這也是證券營業部爲保證投資者資金的安全，防止盜取資金及其他金融詐騙的重要措施。
投資者如以銀行轉賬支票形式存入保證金，由於存入資金不能馬上到賬，投資者應索要收據，待到支票資金到賬後，憑該收據辦理存入保證金手續。(按銀行規定，轉賬支票資金到賬應在提交支票三日以後。)
提醒投資者注意，股票賬戶卡、資金卡等重要證件要保管好，如有可能要經常檢查本人保證金賬戶資金餘額情況，發現問題，儘早解決。
存入營業部的資金如何計息
投資者存入證券營業部的資金按照同期銀行活期利率計息，每年計息支付一次，時間一般在每年的6月底，營業部會將上年的利息結清。在利息支付上，各營業部的具體做法不一。有的營業部會單列一個單子；有的營業部將利息直接存入客戶的資金賬戶，只有在銷戶時，才一次性出具利息單字。在未到支付利息期間，客戶因故需要轉移到另一個營業部，辦理銷戶手續時，原營業部會提前支付客戶的利息。