在市場信息有效性不斷獲得支持性證據的同時，學者們也發現了一些證券市場的特異現象，它們似乎與市場有效性假設相沖突。下面列舉的是一些主要的證券市場的特異現象。
（1）價值效應
歷史上，投資者往往錯誤地高估了成長型公司的股票價值，而低估了價值型公司的股票價值。研究結果發現：價值型股票風險較低，而成長型股票風險最高；低淨資產倍率股票、低價格收入比股票、低市盈率股票均相應地比高淨資產倍率股票、高價格收入比股票、高市盈率股票的業績好，甚至比市場組合股票的業績要好。
（2）特定時間效應
特定時間效應是指在某些特定時間內進行股票交易可以獲得超額收益。
常見的形式有：
一月效應。研究表明，股票，尤其是小規模股票，在歷史上的一月份都產生過不正常的高額回報。
月份交替效應。研究表明，股票一貫在每月的最後一天和開始四天有更高的回報。
週日效應。它是指一週內各個交易日收益和風險的不均勻現象。對美國證券市場的研究表明，週一和週五兩天的股票收益率與其他日顯著不同，週一偏低，週五偏高。中國香港股棗週一的收益率亦顯著小於零。而日本和澳大利亞股市都是週三的收益率在各交易日中最低，並且爲負。但盧森堡股市在週三的收益率卻爲最高。
（3）規模效應
實證研究表明，在美國及國外證券市場上，小公司股票的表現要比大公司的股票表現好。
（4）控制權轉移效應
國內外的學者研究發現：兼併收購中目標公司的股東能夠獲得較高的超額收益率；大宗股權轉讓公告的前後股價會有較大幅度的上漲。
面對上述種種困惑，學者們將注意力從市場有效性理論本身轉向了該理論的前提條件和理論基礎。